COJOCARU Vlad – cercetător colaborator CSII

 

Afiliere: Hubrecht Institute, Utrecht, Țările de Jos / Max Planck Institute for Molecular Biomedicine, Münster, Germania.

Domenii de interes: biochimie moleculară computațională.

Cercetător principal cu expertiză în biochimie moleculară computațională. Am o vastă experiență interdisciplinară și experiență în fizică, chimie și biologie. De-a lungul carierei mele științifice, pornind de la statutul de doctorand la lider de grup de cercetare, m-am străduit să descopăr modul în care structura tridimensională și dinamica moleculelor influențează funcția lor în celule. Am descoperit modul în care proteinele influențează plierea moleculelor de ARN, modul în care enzimele care metabolizează medicamentele se înglobează în membranele lipidice și canalizează moleculele medicamentului de la și către situsurile lor active și cum proteinele specializate care reglează expresia genelor se leagă și explorează ADN-ul. Pentru aceste descoperiri, am folosit diverse metode de modelare moleculară și simulare și instrumente de analiză auto-construite sau stabilite. Am fost întotdeauna ambițioas și mi-au plăcut provocările, în special în proiectarea și conducerea proiectelor în echipe interdisciplinare. Cel mai recent, am condus o mică echipă de cercetare și am îndrumat studenții către finalizarea cu succes a stagiilor de practică sau a doctoratului. Am publicat articole apreciate de cercetare colaborativă în reviste prestigioase și am susținut prelegeri la conferințe internaționale prestigioase și am obținut finanțare din multiple surse pentru cercetările pe care le desfășor.

Curriculum Vitae: Cojocaru_CV

Profil Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=9Xjdu_YAAAAJ&hl=en

Publicații reprezentative:

  • Huertas J, Schöler HR, Cojocaru V (2021). Histone tails cooperate to control the breathing of genomic nucleosomes. PLoS Computational Biology 17(6): e1009013 (featured on issue cover),https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1009013
  • Huertas J, MacCarthy CM, Schöler HR, Cojocaru V (2020). Nucleosomal DNA Dynamics Mediate Oct4 Pioneer Factor Binding. Biophysical Journal 118(9):2280-2296 (featured on issue cover), https://doi.org/10.1016/j.bpj.2019.12.038
  • Öztürk M, Pachov G, Wade RC, Cojocaru V (2016). Conformational selection and dynamic adaptation upon linker histone binding to the nucleosome. Nucleic Acids Research 19;44(14):6599-613 (featured on issue cover), https://doi.org/10.1093/nar/gkw514
  • Merino F, Ng CKL, Veerapandian V, Schöler HR, Jauch R, Cojocaru V (2014). Structural basis for the SOX-dependent genomic redistribution of OCT4 in stem cell differentiation. Structure 22(9):1274-86, https://doi.org/10.1016/j.str.2014.06.014
  • Cojocaru V, Balali-Mood K, Sansom MS, Wade RC (2011). Structure and dynamics of the membrane-bound cytochrome P450 2C9. PLoS Computational Biology 7(8):e1002152 (featured on issue cover), https://doi.org/ 10.1371/journal.pcbi.1002152