A STAR-BBTE Intézetet a BBTE rektorából és rektorhelyetteseiből álló testület irányítja.
A STAR-BBTE Intézet kuratóriumának elnöke dr. Daniel David egyetemi tanár, a BBTE rektora, az intézet koordinátora pedig dr. Markó Bálint egyetemi tanár, versenyképességi rektorhelyettes. Dr. Florin Streteanu egyetemi tanár, a BBTE Szenátusának elnöke megfigyelőként tagja a STAR-BBTE Intézet Tanácsának.
A STAR-BBTE Intézet ügyvezető testülete dr. Alexander Baumgarten egyetemi tanár (Történelem és Filozófia Kar) tudományos igazgatóból, dr. Gabriela Brendea egyetemi docens (Közgazdaság- és Gazdálkodástudományi Kar) ügyvezető igazgató-helyettesből, és dr. Járai-Szabó Ferenc egyetemi docens (Fizika Kar) tudományos titkárból áll.
A BBTE Tudományos Tanácsa a STAR-BBTE Intézeti Tanács tudományos tanácsadó fóruma. A STAR-BBTE Intézet tevékenysége a BBTE Igazgatótanácsa és a BBTE Szenátusa eljárásainak a hatálya alá tartozik.
Nemzetközi akadémiai személyiségek, különös tekintettel a BBTE Doctor Honoris Causa címet elnyerőkre, tagjai a Nemzetközi Tanácsadó Testületnek, melynek feladata, hogy javaslatokat tegyen a STAR-BBTE Intézet működésére és fejlesztésére, valamint négyévente nemzetközi értékelést végezzen a STAR-BBTE Intézet Tanácsának jelentése alapján.
- dr. Jurgen Heinze egyetemi tanár, University of Regensburg, Németország
- dr. Harald Heppner, egyetemi tanár, University of Graz, Ausztria
- dr. Zoltan Horvath, egyetemi tanár, Eötvös Loránd Tudományegyetem, Magyarország
- dr. Irving Kirsch, egyetemi tanár, Harvard Medical School, Amerikai Egyesült Államok
- dr. Jean-Marie Lehn, egyetemi tanár, University of Strasbourg, Franciaország
- dr. Eric Maskin, egyetemi tanár, Harvard University, Amerikai Egyesült Államok
- dr. Carole Neves, Smithsonian Institution, Amerikai Egyesült Államok
- dr. Ariel Pakes, egyetemi tanár, Harvard University, Amerikai Egyesült Államok